검은조직의 보스 ‘그분’의 정체가 밝혀지다! 명탐정 코난 95권[명탐정 코난] 94권에 이어 수학여행 에피소드의 뒷이야기가 펼쳐진다. 수학여행 중 신이치의 몸으로 살인사건의 범인을 마침내 밝히는 코난. 그러나 이로 인해 코난(=신이치)는 큰 문제에 연루되게 되는데…! 한편 이 문제를 해결하기 위해...